Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxn3Q499D0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms