Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Esf1Q3V1V3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Esf1Q3V1V3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms