Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms