Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930596D02RikQ3V0H9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms