Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm5aQ3UXZ9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms