Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms