Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ2

Ubtfl1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtfl1Q3USZ2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubtfl1Q3USZ2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubtfl1Q3USZ2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubtfl1Q3USZ2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubtfl1Q3USZ2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubtfl1Q3USZ2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubtfl1Q3USZ2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubtfl1Q3USZ2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubtfl1Q3USZ2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubtfl1Q3USZ2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubtfl1Q3USZ2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubtfl1Q3USZ2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubtfl1Q3USZ2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubtfl1Q3USZ2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubtfl1Q3USZ2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubtfl1Q3USZ2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubtfl1Q3USZ2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubtfl1Q3USZ2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubtfl1Q3USZ2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubtfl1Q3USZ2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubtfl1Q3USZ2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubtfl1Q3USZ2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubtfl1Q3USZ2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubtfl1Q3USZ2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms