Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Znf48Q3US17 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Znf48Q3US17 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Znf48Q3US17 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Znf48Q3US17 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Znf48Q3US17 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Znf48Q3US17 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Znf48Q3US17 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Znf48Q3US17 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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Znf48Q3US17 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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