Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nkain3Q3URJ8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Nkain3Q3URJ8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Nkain3Q3URJ8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Nkain3Q3URJ8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nkain3Q3URJ8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms