Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp560Q3URI6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms