Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms