Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skap2Q3UND0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skap2Q3UND0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms