Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms