Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms