Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms