Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Puf60Q3UEB3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms