Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms