Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms