Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cwc27Q3TKY6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms