Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms