Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms