Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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