Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp8Q2V6D6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms