Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms