Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Fam178bQ24JP3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Fam178bQ24JP3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Fam178bQ24JP3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms