Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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