Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cpne9Q1RLL3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cpne9Q1RLL3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne9Q1RLL3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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