Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim71Q1PSW8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms