Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Fam171bQ14CH0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Fam171bQ14CH0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Fam171bQ14CH0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Fam171bQ14CH0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Fam171bQ14CH0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam171bQ14CH0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Fam171bQ14CH0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam171bQ14CH0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam171bQ14CH0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Fam171bQ14CH0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam171bQ14CH0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam171bQ14CH0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam171bQ14CH0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Fam171bQ14CH0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Fam171bQ14CH0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam171bQ14CH0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Fam171bQ14CH0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam171bQ14CH0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam171bQ14CH0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam171bQ14CH0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Fam171bQ14CH0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Fam171bQ14CH0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam171bQ14CH0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Fam171bQ14CH0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Fam171bQ14CH0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Fam171bQ14CH0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam171bQ14CH0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam171bQ14CH0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam171bQ14CH0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam171bQ14CH0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam171bQ14CH0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam171bQ14CH0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam171bQ14CH0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam171bQ14CH0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam171bQ14CH0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam171bQ14CH0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam171bQ14CH0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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