Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms