Protein–RNA interactions for Protein: Q14B98

Fam109b, Sesquipedalian-2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam109bQ14B98 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam109bQ14B98 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam109bQ14B98 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms