Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q149G0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q149G0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q149G0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q149G0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q149G0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q149G0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q149G0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q149G0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q149G0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q149G0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q149G0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Q149G0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Q149G0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Q149G0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Q149G0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Q149G0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Q149G0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Q149G0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Q149G0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Q149G0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Q149G0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Q149G0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Q149G0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Q149G0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Q149G0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q149G0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q149G0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Q149G0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q149G0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Q149G0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q149G0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q149G0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q149G0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q149G0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q149G0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q149G0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q149G0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q149G0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q149G0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q149G0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q149G0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q149G0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Q149G0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q149G0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q149G0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q149G0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q149G0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Q149G0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms