Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms