Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms