Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2b3Q0VF55 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2b3Q0VF55 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms