Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne7Q0VE82 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms