Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc1Q0VDN7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms