Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntnap5bQ0V8T8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms