Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntnap5cQ0V8T7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5cQ0V8T7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms