Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc7a1Q09143 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc7a1Q09143 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms