Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700061G19RikQ08EE8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700061G19RikQ08EE8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms