Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms