Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms