Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprgQ05909 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms