Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk18Q04899 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms