Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms