Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr5Q04683 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cxcr5Q04683 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cxcr5Q04683 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cxcr5Q04683 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cxcr5Q04683 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cxcr5Q04683 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cxcr5Q04683 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr5Q04683 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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