Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms