Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms