Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnd1Q03719 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms